DsRed

La DsRed est une protéine tétramérique ayant la propriété d'émettre une fluorescence de couleur rouge. Issue d'un corail (Discosoma ), cette protéine est intrinsèquement fluorescente. Son gène peut être fusionné in-vitro au gène d'une protéine qu'on souhaite étudier. Le gène recombinant est ensuite réintroduit dans des cellules ou un embryon, qui va alors synthétiser la protéine de fusion, alors fluorescente. On pourra alors l'observer avec un microscope à fluorescence, par exemple. Cette méthode permet d'étudier les protéines dans leur environnement naturel : la cellule vivante.

La DsRed, un maximum d'excitation à 558 nm (lumière verte). La longueur d'onde d'émission maximale est à 583 nm. L'un de ses défauts rédhibitoires est la lenteur de maturation de la protéine car l'une des formes intermédiaires possède une fluorescence verte comparable à celle de la protéine fluorescente verte (GFP).

Il existe désormais différents variants de la DsRed qui ont été obtenus en modifiant celle-ci par ingénierie génétique. Ces étapes de mutation ont permis d'obtenir des formes dimériques, monomériques, d'augmenter la brillance ou de changer la gamme de longueur d'ondes concernées par les spectres d'excitation et d'émission.

Variants obtenus par mutagenèse :

• dimer2  : variant dimérique
• mRFP  : variant monomérique, maturation lente

• dTomato  : variant dimérique
• tdTomato  : variant tétramérique
• mOrange  : variant monomérique, fluorescence orange
• mBanana  : variant monomérique, fluorescence orange
• mHoneydew  : variant monomérique, fluorescence verte-orange
• mStrawberry  : variant monomérique, fluorescence rouge entre DsRed et mRFP.
• mCherry  : variant monomérique, fluorescence comparable à mRFP avec une maturation plus rapide et une meilleure stabilité.

Références

• Shaner et al. Nature Biotechnology 22 :1567-1572 (2004)

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